Музей был основан в 1879 году Иваном Яковлевичем Словцовым (1844 – 1907 гг.) – известным учёным – энциклопедистом, директором Тюменского Александровского реального училища. Немалый вклад в создание его коллекций внёс Николай Мартемьянович Чукмалдин (1836 – 1901 гг.), тюменский, а позднее московский купец и меценат.
Музей был основан в 1879 г. Иваном Яковлевичем Словцовым (1844 – 1907 гг.) – известным учёным – энциклопедистом, директором Тюменского Александровского реального училища. Немалый вклад в создание его коллекций внёс Николай Мартемьянович Чукмалдин (1836 – 1901 гг.), тюменский, а позднее московский купец и меценат.  Тюменский музей с самого основания формировался как многопрофильный краеведческий и научный музей.

Он всегда входил в число крупных музеев Сибири. Такое значение музей сохраняет и в настоящее время. Музей состоит членом ряда организаций российского музейного сообщества: ИКОМ России, Союза музеев России.

Сегодня в состав ГАУК ТО «Музейный комплекс им. И.Я. Словцова», помимо фондохранилища, входят пять музеев - филиалов, экспозиции которых посвящены различным аспектам естественной, социальной и культурной истории края. Собрание музея в настоящее время насчитывает более 300 000 единиц хранения. К числу раритетов по праву относятся издания славянских первопечатников Франциска Скорины и Ивана Фёдорова, напрестольный крест – энколпион царя Алексея Михайловича, уникальная коллекция, связанная со становлением и развитием тюменского нефте-газоносного региона, редчайшие документальные источники, пр.  ГАУК ТО «Музейный комплекс им. И. Я. Словцова» – одно из ведущих учреждений культуры Тюменской области, которое объединяет пять различных музеев и во многом определяет культурный облик Сибири. Выставки краеведческого направления в Музее-усадьбе Колокольниковых, музеях «Дом Машарова» и «Городская Дума»; живопись, графика и скульптура Музея изобразительных искусств, а также замечательная археологическая экспозиция музея-заповедника на оз. Андреевском – вот то, что, наряду с увлекательными программами, экскурсиями и привозными проектами, ждёт посетителей «Музейного Комплекса».